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Plan du cours
Introduction au langage de programmation Python
- Pourquoi Python ?
- Utiliser Python pour traiter des données biologiques
- Travailler avec l'interpréteur de commandes iPython
- Votre premier programme
- Écrire des scripts Python
- Importer des modules
Travailler avec des séquences de protéines et d'ARN/ADN
- Trouver des motifs
- Transcription et traduction in silico
- Traitement des alignements de séquences
Analyse des données dans différents formats biologiques
- Analyse de FASTA
- Conversions de formats de données
Exécution d'analyses biologiques
- BLAST
- [Services web biologiques
Traitement des structures biologiques en 3D à l'aide de Python
Python facilite l'analyse statistique
Visualisation des données
- Création de diagrammes à barres et de diagrammes de dispersion
- Calculer l'aire sous la courbe (AUC)
Travailler avec des fichiers .xls et .csv
- Importer des données depuis et exporter vers MS Excel / OpenOffice Calc
- Rédaction de fichiers .xls et .csv
Utilisation de Python pour créer un pipeline de traitement de données automatisé
Pré requis
Connaissances biologiques de base sur les séquences de protéines, d'ARN et d'ADN.
28 Heures
Nos clients témoignent (1)
L'accessibilité du formateur et sa capacité à communiquer sont très efficaces,
Ciprian Ilie - Institutul National de Sanatate Publica
Formation - Programming for Biologists
Traduction automatique